RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576502.5

NDE1-211, Transcript of nudE neurodevelopment protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene NDE1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1-211ENST00000576502 K7ESF4 209 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 APBB3O95704 486 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 CYBBP04839 570 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 LCP1P13796 627 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 GNA15P30679 374 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 USP8P40818 1118 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 FNTBP49356 437 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 PGFP49763 221 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SNX16P57768 344 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ZNF445P59923 1031 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 PKDCCQ504Y2 493 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 CEP68Q76N32 757 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TFAP2BQ92481 460 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 KAT5Q92993 513 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 BBS2Q9BXC9 721 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 MARK1Q9P0L2 795 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SLC12A8A0AV02 714 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 MDM4O15151 490 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 STC2O76061 302 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ALDH1A2O94788 518 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 KDSRQ06136 332 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 DMC1Q14565 340 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 VWA3BQ502W6 1294 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 EOGTQ5NDL2 527 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 USP33Q8TEY7 942 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 NOX5Q96PH1 765 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 NDST4Q9H3R1 872 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ST7Q9NRC1 585 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ANO10Q9NW15 660 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.48□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 A0A0A0MRY4 1105 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 KCNJ18B7U540 433 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TULP2O00295 520 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 THAP12O43422 761 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 CACNG3O60359 315 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TULP3O75386 442 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 HMBSP08397 361 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TYRP14679 529 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SLC9A1P19634 815 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 PON1P27169 355 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SLC6A11P48066 632 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 RGS7P49802 495 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 DGKEP52429 567 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 SEC13P55735 322 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 DAOAP59103 153 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 BPIFB4P59827 614 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 PTK2Q05397 1052 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 KCNJ12Q14500 433 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 GAB4Q2WGN9 574 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 C2orf27AQ580R0 203 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 PMF1Q6P1K2 205 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 Q6ZNB5 142 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 C11orf74Q86VG3 221 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TMEM25Q86YD3 366 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 TERB1Q8NA31 727 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 STK32AQ8WU08 396 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 MMP17Q9ULZ9 603 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 CEP83Q9Y592 693 aa14.47□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.46□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.46□□□□□ -0.09
NDE1-211ENST00000576502 E7ENQ6 273 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms