RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575454.1

SMG6-218, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 652 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-218ENST00000575454 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 RAD54BQ9Y620 910 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 PTPRJQ12913 1337 aa9.51□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 GREM1O60565 184 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 PHACTR2O75167 634 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 AP1G2O75843 785 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 IGLV3-19P01714 112 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 NEFLP07196 543 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CISD3P0C7P0 127 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 P4HA1P13674 534 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CHKAP35790 457 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 STAT6P42226 847 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ABCG1P45844 678 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 PLA2G4AP47712 749 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 TPMTP51580 245 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 AP3M2P53677 418 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CDH8P55286 799 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ORC1Q13415 861 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 TEAD4Q15561 434 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 FUT11Q495W5 492 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 USP49Q70CQ1 688 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 FAM35AQ86V20 835 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 TMX3Q96JJ7 454 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CGRRF1Q99675 332 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 IL21RQ9HBE5 538 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CYLDQ9NQC7 956 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 FBXO10Q9UK96 956 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.5□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 APC2O95996 2303 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CAPN8A6NHC0 703 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 WASH3PC4AMC7 463 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 TIMM44O43615 452 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 DFNA5O60443 496 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CLSTN1O94985 981 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 TBX18O95935 607 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 HLA-EP13747 358 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ACO1P21399 889 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 PSEN1P49768 467 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 AMPD3Q01432 767 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CYP24A1Q07973 514 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ENPP2Q13822 863 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ADAM32Q8TC27 787 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 DNAI2Q9GZS0 605 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 KRT82Q9NSB4 513 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 SCML2Q9UQR0 700 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 NME7Q9Y5B8 376 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CITO14578 2027 aa9.49□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 A0A1B0GVT2 93 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 PCDHGA12O60330 932 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CYBBP04839 570 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 PDCP20941 246 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 IL12RB1P42701 662 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 MYL6P60660 151 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 COG7P83436 770 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 CAMK2BQ13554 666 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 KIF19Q2TAC6 998 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ZNF699Q32M78 642 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 Q6ZNB5 142 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 UNC93AQ86WB7 457 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 FUKQ8N0W3 1084 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 RDH13Q8NBN7 331 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 SLC39A7Q92504 469 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 IGSF8Q969P0 613 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 WBP2Q969T9 261 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.48□□□□□ -0.89
SMG6-218ENST00000575454 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.48□□□□□ -0.89
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