RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 P2RY11Q96G91 374 aa16.38■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PAGE5Q96GU1 130 aa16.38■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 BACH2Q9BYV9 841 aa16.38■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.38■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 CYLDQ9NQC7 956 aa16.38■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa16.38■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PLK2Q9NYY3 685 aa16.38■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 A0A1W2PQH9 124 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 HHLA1C9JL84 531 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SLFN14P0C7P3 912 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 TRIM49P0CI25 452 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 TRIM49CP0CI26 452 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 CD58P19256 250 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 ACO1P21399 889 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 ZNF33AQ06730 810 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 UNC93AQ86WB7 457 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 CD248Q9HCU0 757 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SCML2Q9UQR0 700 aa16.37■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 DSPP15924 2871 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 ATRXP46100 2492 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 WASH3PC4AMC7 463 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 KIF20AO95235 890 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 RARGP13631 454 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 DGKGP49619 791 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PIP4P1Q86T03 277 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 TRIML1Q8N9V2 468 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 TMC2Q8TDI7 906 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 TAF4BQ92750 862 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 GATA6Q92908 595 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SLC32A1Q9H598 525 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 CAPN10Q9HC96 672 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 MARK1Q9P0L2 795 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 NAGPAQ9UK23 515 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SLC6A14Q9UN76 642 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 STARD13Q9Y3M8 1113 aa16.36■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GVL5 298 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PDXKO00764 312 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SERPINF2P08697 491 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PRR29P0C7W0 189 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PFKFB1P16118 471 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 HOXD12P35452 270 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 DPP6P42658 865 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 GCLMP48507 274 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 FAM193AP78312 1265 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 INCA1Q0VD86 236 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SEMA3BQ13214 749 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SDE2Q6IQ49 451 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 MINDY1Q8N5J2 469 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 GABRG3Q99928 467 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 KLK13Q9UKR3 277 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.35■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 HMBSP08397 361 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 CISD3P0C7P0 127 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PPP3CAQ08209 521 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 Q6ZNB5 142 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 SCD5Q86SK9 330 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 MRGPRX1Q96LB2 322 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa16.34■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 CKAP5Q14008 2032 aa16.33■□□□□ 0.21
NME3-211ENST00000568561 IKBKBO14920 756 aa16.33■□□□□ 0.2
NME3-211ENST00000568561 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
NME3-211ENST00000568561 OPHN1O60890 802 aa16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms