RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LRRC28-222	ENST00000561431	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LRRC28-222	ENST00000561431	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LRRC28-222	ENST00000561431	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LRRC28-222	ENST00000561431	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
LRRC28-222	ENST00000561431	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LRRC28-222	ENST00000561431	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431		A0A087WWL8	130 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	NCK2	O43639	380 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	RGS10	O43665	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TCEA3	O75764	348 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SOAT2	O75908	522 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MTA2	O94776	668 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	HMOX1	P09601	288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SRGN	P10124	158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TGFB3	P10600	412 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	LAG3	P18627	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	VIPR2	P41587	438 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	HTR3A	P46098	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TM4SF4	P48230	202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PRKAG1	P54619	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	CXADR	P78310	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MTA1	Q13330	715 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	INSC	Q1MX18	579 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TRIAP1	O43715	76 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ORC4	O43929	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	INMT	O95050	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	RASAL1	O95294	804 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MT-ND5	P03915	603 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	CFI	P05156	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TSHR	P16473	764 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ABCB4	P21439	1286 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SERPINB3	P29508	390 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	CD6	P30203	668 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PEX19	P40855	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	NPTX2	P47972	431 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	NDUFV1	P49821	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ITGA8	P53708	1063 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	INHBE	P58166	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	LILRA4	P59901	499 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM189B	P81408	668 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ITPK1	Q13572	414 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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