RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560272.1

LINS1-208, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 2

Gene LINS1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-208ENST00000560272 HLA-DRAP01903 254 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CFIP05156 583 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 RALAP11233 206 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CEACAM1P13688 526 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 HOXB2P14652 356 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CMA1P23946 247 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 NR2F2P24468 414 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 NTSR1P30989 418 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SYKP43405 635 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ASPAP45381 313 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SLC8A3P57103 927 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 KRT85P78386 507 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 IRX4P78413 519 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 INCA1Q0VD86 236 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 MESP2Q0VG99 397 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ORC1Q13415 861 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 E2F5Q15329 346 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 EMC10Q5UCC4 262 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 TMEM25Q86YD3 366 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CHPFQ8IZ52 775 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 TTC39CQ8N584 583 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 C12orf29Q8N999 325 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CEP76Q8TAP6 659 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 RLN3Q8WXF3 142 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SPATA32Q96LK8 384 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 BBS2Q9BXC9 721 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SDCBP2Q9H190 292 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SLC32A1Q9H598 525 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CYLDQ9NQC7 956 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 MARK1Q9P0L2 795 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SCML2Q9UQR0 700 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CEP250Q9BV73 2442 aa6.29□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ANTXRLA6NF34 631 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CYP26A1O43174 497 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 STX10O60499 249 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 NDUFS2O75306 463 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 TRIM49P0CI25 452 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 TRIM49CP0CI26 452 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 RARGP13631 454 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 TYRP14679 529 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ENGP17813 658 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 GABRG2P18507 467 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CD58P19256 250 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 PTGER3P43115 390 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 MAPK8P45983 427 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 PLA2G4AP47712 749 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 GCLMP48507 274 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 DGKGP49619 791 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 COG7P83436 770 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 ENPEPQ07075 957 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 FOXC1Q12948 553 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 PKP1Q13835 747 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 STARD3Q14849 445 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 NFIL3Q16649 462 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 KRT39Q6A163 491 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.28□□□□□ -1.4
LINS1-208ENST00000560272 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms