RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559282.1

BLM-204, Transcript of Bloom syndrome RecQ like helicase, human

TSL 3

Gene BLM, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BLM-204	ENST00000559282	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	CA12	O43570	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	RNF8	O76064	485 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	AR	P10275	920 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	CYP2D6	P10635	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	DRD1	P21728	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	CERS1	P27544	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	HTR7	P34969	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	TEC	P42680	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	TFF2	Q03403	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	BFSP2	Q13515	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	STARD3	Q14849	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	ACOX1	Q15067	660 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	MUL1	Q969V5	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	TISP43	B9A030	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	PBX1	P40424	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	GSTM5	P46439	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	CFHR3	Q02985	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	KCNB1	Q14721	858 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	DDB2	Q92466	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	RITA1	Q96K30	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM-204	ENST00000559282	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CLIC1	O00299	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PLA2G6	O60733	806 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PPM1A	P35813	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	RAB30	Q15771	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	DPF1	Q92782	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PMM1	Q92871	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	WDR24	Q96S15	920 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	FYB1	O15117	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GLP2R	O95838	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	MMP8	P22894	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	EPHB2	P29323	1055 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	MPG	P29372	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GALNS	P34059	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	JAK3	P52333	1124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GPC5	P78333	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	FOXF2	Q12947	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	MTAP	Q13126	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms