RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	BBS2	Q9BXC9	721 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CD248	Q9HCU0	757 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DKK4	Q9UBT3	224 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ATRX	P46100	2492 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CBFA2T3	O75081	653 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PHACTR2	O75167	634 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CER1	O95813	267 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TYR	P14679	529 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	OXTR	P30559	389 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	WAS	P42768	502 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DGKG	P49619	791 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	AP3M2	P53677	418 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SLC5A3	P53794	718 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	STX17	P56962	302 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	STARD3	Q14849	445 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PSMD6	Q15008	389 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	KCNK16	Q96T55	309 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CGRRF1	Q99675	332 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CDC6	Q99741	560 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CYLD	Q9NQC7	956 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	HCN2	Q9UL51	889 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NME7	Q9Y5B8	376 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CHD6	Q8TD26	2715 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PTPRJ	Q12913	1337 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	THADA	Q6YHU6	1953 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NUP205	Q92621	2012 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ANK1	P16157	1881 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FRYL	O94915	3013 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	METTL12	A8MUP2	240 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MEI4	A8MW99	385 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PRRT4	C9JH25	899 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CLDN5	O00501	218 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	FLRT2	O43155	660 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TGFB1I1	O43294	461 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GREM1	O60565	184 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	TLR5	O60602	858 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	RHOBTB3	O94955	611 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	SMC2	O95347	1197 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	P4HA1	P13674	534 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	BMP6	P22004	513 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PRCP	P42785	496 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	PSEN1	P49768	467 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CACNA2D1	P54289	1103 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	MYL6	P60660	151 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CYP24A1	Q07973	514 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	GRIK2	Q13002	908 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		7.22	□□□□□ -1.25
CS-233	ENST00000552688	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		7.22	□□□□□ -1.25

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