RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	DAOA	P59103	153 aa		21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	KCNJ12	Q14500	433 aa		21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	STIL	Q15468	1287 aa		21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SCML4	Q8N228	414 aa		21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SHC3	Q92529	594 aa		21.89	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	GPD2	P43304	727 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	FNTB	P49356	437 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	KCNMA1	Q12791	1236 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	FBXO43	Q4G163	708 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	EDEM1	Q92611	657 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		21.88	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	TRIM24	O15164	1050 aa		21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	HMBS	P08397	361 aa		21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	KDSR	Q06136	332 aa		21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	NAT16	Q8N8M0	369 aa		21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	USP33	Q8TEY7	942 aa		21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	HSFY1	Q96LI6	401 aa		21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	21.87	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	MBD3	O95983	291 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	GNA15	P30679	374 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SEC13	P55735	322 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	GAD2	Q05329	585 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	PPP2R5D	Q14738	602 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	EXOC4	Q96A65	974 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	PNKP	Q96T60	521 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		21.86	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SLC12A8	A0AV02	714 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	THAP12	O43422	761 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	TULP3	O75386	442 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	KAT7	O95251	611 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	HOXA6	P31267	233 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	USP8	P40818	1118 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	COG7	P83436	770 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	ANO4	Q32M45	955 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	FAM81B	Q96LP2	452 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	EPC1	Q9H2F5	836 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	MARK1	Q9P0L2	795 aa		21.85	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996		A0A0A0MRY4	1105 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	NRL	P54845	237 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	KRT31	Q15323	416 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	MEA1	Q16626	185 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	C2orf27A	Q580R0	203 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	EMC10	Q5UCC4	262 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	HHIP	Q96QV1	700 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	MIS12	Q9H081	205 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	ANO10	Q9NW15	660 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	FANCL	Q9NW38	375 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		21.84	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		21.83	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	21.83	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	HR	O43593	1189 aa		21.83	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	CACNG3	O60359	315 aa		21.83	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	ATG13	O75143	517 aa		21.83	■■□□□ 1.09
CS-222	ENST00000550996	FYN	P06241	537 aa		21.83	■■□□□ 1.09

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