RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 OPRD1P41143 372 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CCR3P51677 355 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 BBS7Q8IWZ6 715 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 STK33Q9BYT3 514 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 MYO15AQ9UKN7 3530 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 SP9P0CG40 484 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 TDGF1P13385 188 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 GAD2Q05329 585 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 WBP2Q969T9 261 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 VPS16Q9H269 839 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ATG2BQ96BY7 2078 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 VPS13AQ96RL7 3174 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 LGALS16A8MUM7 142 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 THAP12O43422 761 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 PPP2R5DQ14738 602 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM217AQ8IXS0 508 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 PLD4Q96BZ4 506 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 GANQ9H2C0 597 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ACP6Q9NPH0 428 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 NUDT5Q9UKK9 219 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 FHOD1Q9Y613 1164 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 DMDP11532 3685 aa24.37■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ATG13O75143 517 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CALCAP01258 141 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 LY6G5CQ5SRR4 150 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ZBTB44Q8NCP5 570 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 SMTNL1A8MU46 457 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 MDM4O15151 490 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CAVIN2O95810 425 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 LATS1O95835 1130 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 LTFP02788 710 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 KLKB1P03952 638 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ADH5P11766 374 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 LCP1P13796 627 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CHKAP35790 457 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CXCL12P48061 93 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 RGS7P49802 495 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 EFEMP1Q12805 493 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 NNTQ13423 1086 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CPXM2Q8N436 756 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.35■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 EGFP01133 1207 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 GLI1P08151 1106 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 RING1Q06587 406 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 PDCLQ13371 301 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 TTC16Q8NEE8 873 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 RNF139Q8WU17 664 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 AZIN2Q96A70 460 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 ASNSD1Q9NWL6 643 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 FBXO10Q9UK96 956 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 F8VZ95 297 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 CACNG3O60359 315 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 LILRB5O75023 590 aa24.33■■□□□ 1.49
CTDSP2-203ENST00000547701 IGLV3-27P01718 113 aa24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms