RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 USP8P40818 1118 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC11A2P49281 568 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TKTL1P51854 596 aa5.88□□□□□ -1.47
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CLSTN3-215ENST00000544584 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.476e-7■■■■□ 19.4
CLSTN3-215ENST00000544584 RRAGAQ7L523 313 aa5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SYT13Q7L8C5 426 aa5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 RABEPKQ7Z6M1 372 aa5.87□□□□□ -1.47
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