RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 F8VP50 259 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 TREHO43280 583 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.49□□□□□ -0.89
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THBS3-211ENST00000541990 ACTR3P61158 418 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ARHGAP8P85298 464 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 OGDHQ02218 1023 aa9.49□□□□□ -0.89
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THBS3-211ENST00000541990 MORF4L2Q15014 288 aa9.49□□□□□ -0.89
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THBS3-211ENST00000541990 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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THBS3-211ENST00000541990 EXD1Q8NHP7 514 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ZNF516Q92618 1163 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 EBF4Q9BQW3 602 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 VPS11Q9H270 941 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CA12O43570 354 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CTSHP09668 335 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SLC25A3Q00325 362 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PEX6Q13608 980 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NCOA4Q13772 614 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 GNASQ5JWF2 1037 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SPATA24Q86W54 205 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 RDM1Q8NG50 284 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 OR5B17Q8NGF7 314 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NLRP7Q8WX94 980 aa9.48□□□□□ -0.89
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THBS3-211ENST00000541990 ATXN10Q9UBB4 475 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.48□□□□□ -0.89
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THBS3-211ENST00000541990 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 A8MXQ7 604 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 TM7SF2O76062 418 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PDE5AO76074 875 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 C22orf31O95567 290 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 VAV1P15498 845 aa9.48□□□□□ -0.89
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THBS3-211ENST00000541990 LAMC2Q13753 1193 aa9.48□□□□□ -0.89
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THBS3-211ENST00000541990 CNTN3Q9P232 1028 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.48□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 TM9SF1O15321 606 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MAGEC1O60732 1142 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MT-ND3P03897 115 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NOMO3P69849 1222 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 BST1Q10588 318 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PTP4A2Q12974 167 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PTK7Q13308 1070 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MYBPC2Q14324 1141 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 GRIK4Q16099 956 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.47□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PAOXQ6QHF9 649 aa9.47□□□□□ -0.89
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