RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	KRT9	P35527	623 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	CCIN	Q13939	588 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	RNF139	Q8WU17	664 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	CD101	Q93033	1021 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	MIS12	Q9H081	205 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	GAN	Q9H2C0	597 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	LHX5	Q9H2C1	402 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	ST7	Q9NRC1	585 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CTSB-231	ENST00000534382	LAMTOR5	O43504	91 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	ADH1C	P00326	375 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	ADH5	P11766	374 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	ATP1A3	P13637	1013 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	DRD1	P21728	446 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	KLK7	P49862	253 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	UBXN1	Q04323	297 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	MTAP	Q13126	283 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SYCP1	Q15431	976 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	GAB4	Q2WGN9	574 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM110	Q86TL2	294 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	EDEM1	Q92611	657 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	GOLGA1	Q92805	767 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	FAM122A	Q96E09	287 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		15.2	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SLC12A8	A0AV02	714 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382		F8VZ95	297 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	LTF	P02788	710 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	HMBS	P08397	361 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	PLA2G5	P39877	138 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	OPRD1	P41143	372 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	GAD2	Q05329	585 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	PDCL	Q13371	301 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	IQCB1	Q15051	598 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382		Q6ZNB5	142 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM25	Q86YD3	366 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	DCLK3	Q9C098	648 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382		E5RJQ4	531 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	EPHB6	O15197	1021 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	EGF	P01133	1207 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	KLKB1	P03952	638 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SP9	P0CG40	484 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	CYP11B1	P15538	503 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	GAS6	Q14393	721 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	FBXO43	Q4G163	708 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382		Q6ZS52	159 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	PASD1	Q8IV76	773 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	NEK11	Q8NG66	645 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	CEP83	Q9Y592	693 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	CXCL12	P48061	93 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SLC6A11	P48066	632 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	CCR3	P51677	355 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	SNX16	P57768	344 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	ANO4	Q32M45	955 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	BEND5	Q7L4P6	421 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	PLD4	Q96BZ4	506 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CTSB-231	ENST00000534382	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		15.17	■□□□□ 0.02

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