RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 PRR29P0C7W0 189 aa24.08■■□□□ 1.45
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PKP3-210ENST00000533249 ITPKAP23677 461 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-210ENST00000533249 NR2F2P24468 414 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-210ENST00000533249 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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PKP3-210ENST00000533249 DEFB124Q8NES8 71 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-210ENST00000533249 BHMTQ93088 406 aa24.08■■□□□ 1.45
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PKP3-210ENST00000533249 STARD13Q9Y3M8 1113 aa24.08■■□□□ 1.45
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PKP3-210ENST00000533249 KRT13P13646 458 aa24.07■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-210ENST00000533249 SDE2Q6IQ49 451 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-210ENST00000533249 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa24.07■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 NAGPAQ9UK23 515 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-210ENST00000533249 CEP192Q8TEP8 1941 aa24.07■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 MAPK13O15264 365 aa24.06■■□□□ 1.44
PKP3-210ENST00000533249 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 SYKP43405 635 aa24.06■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 DNMT3LQ9UJW3 386 aa24.06■■□□□ 1.44
PKP3-210ENST00000533249 PILRBQ9UKJ0 227 aa24.06■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 RHOBTB3O94955 611 aa24.05■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa24.04■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 PROS1P07225 676 aa24.03■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 ZNF217O75362 1048 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-210ENST00000533249 CISD3P0C7P0 127 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-210ENST00000533249 RALAP11233 206 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-210ENST00000533249 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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PKP3-210ENST00000533249 PSEN1P49768 467 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-210ENST00000533249 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
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