RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531920.6

MED17-208, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 3

Gene MED17, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-208	ENST00000531920	PEPD	P12955	493 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	TNFRSF1A	P19438	455 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	EPHA3	P29320	983 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	GSTM5	P46439	218 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	POLD2	P49005	469 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	MTHFS	P49914	203 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	PDE6C	P51160	858 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	CCR9	P51686	369 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	ZXDA	P98168	799 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	PLP2	Q04941	152 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	TDG	Q13569	410 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	GPR68	Q15743	365 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	ICE2	Q659A1	982 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	LGI4	Q8N135	537 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	SYNE4	Q8N205	404 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	USP38	Q8NB14	1042 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	SNX19	Q92543	992 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	MIEF2	Q96C03	454 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	RNF181	Q9P0P0	153 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	BAG5	Q9UL15	447 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	GPR34	Q9UPC5	381 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	COL15A1	P39059	1388 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	PPM1D	O15297	605 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	TRIAP1	O43715	76 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	DOK2	O60496	412 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	TSPAN3	O60637	253 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	CBFA2T3	O75081	653 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	TIPRL	O75663	272 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	WDR47	O94967	919 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	PDHA1	P08559	390 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	GGT5	P36269	586 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	MCM2	P49736	904 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	TUBB3	Q13509	450 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	BFSP2	Q13515	415 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	ERV3-1	Q14264	604 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	FUK	Q8N0W3	1084 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	APOPT1	Q96IL0	206 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	SERINC2	Q96SA4	455 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	MNT	Q99583	582 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	IL21R	Q9HBE5	538 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	RAB21	Q9UL25	225 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	NFU1	Q9UMS0	254 aa		5	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	PEX12	O00623	359 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	TMCC2	O75069	709 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	RECQL4	O94761	1208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	CSF1	P09603	554 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	ALAD	P13716	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	THBS4	P35443	961 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	RAD52	P43351	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	CDK7	P50613	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MED17-208	ENST00000531920	RABGGTB	P53611	331 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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