RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 ALDH1A3P47895 512 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SLC6A9P48067 706 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HMGA2P52926 109 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SLC16A1P53985 500 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ICA1Q05084 483 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC57Q2TAC2 916 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MVB12AQ96EY5 273 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MRGBPQ9NV56 204 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FZD1Q9UP38 647 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 WNT10BO00744 389 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TEX33O43247 280 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 GPR32O75388 356 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ALDH2P05091 517 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31D3P0C874 917 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LAG3P18627 525 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FPR1P21462 350 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FGFR2P21802 821 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CHMLP26374 656 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RFC4P35249 363 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CHN2P52757 468 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CACNB3P54284 484 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TIMM10P62072 90 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 BLMHQ13867 455 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TAF12Q16514 161 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 USP45Q70EL2 814 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MRGPREQ86SM8 312 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ESX1Q8N693 406 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LENG9Q96B70 501 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LRFN3Q9BTN0 628 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 IL25Q9H293 177 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MYH7P12883 1935 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GUL7 405 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 DRGXA6NNA5 263 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TOR1BO14657 336 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PLOD3O60568 738 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NCR1O76036 304 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MTA2O94776 668 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ABHD16AO95870 558 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ITGB1P05556 798 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ELF1P32519 619 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HOXD12P35452 270 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CASP5P51878 434 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 FAM189BP81408 668 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ROR1Q01973 937 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TAF5Q15542 800 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 MED25Q71SY5 747 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SNX32Q86XE0 403 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NKAIN3Q8N8D7 197 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 LSMEM1Q8N8F7 131 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF527Q8NB42 609 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 HVCN1Q96D96 273 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 NYXQ9GZU5 481 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 CARMIL3Q8ND23 1372 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-214ENST00000530727 GAGE12BA1L429 117 aa4.63□□□□□ -1.67
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