RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-210	ENST00000522344	PRAMEF2	O60811	474 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	NDST3	O95803	873 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	MYL4	P12829	197 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TRIM27	P14373	513 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	DRD1	P21728	446 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PBX1	P40424	430 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	GPC5	P78333	572 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	GHRHR	Q02643	423 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC14A1	Q13336	389 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	BFSP2	Q13515	415 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF425	Q6IV72	752 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PJA1	Q8NG27	643 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	COL15A1	P39059	1388 aa		5	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	FCHO1	O14526	889 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ADAM10	O14672	748 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	NCK2	O43639	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	BCAR3	O75815	825 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	AR	P10275	920 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	IDE	P14735	1019 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	GALNS	P34059	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	GNAL	P38405	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	FHL3	Q13643	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	RABEP1	Q15276	862 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	SEC23B	Q15437	767 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344		Q4G0T1	1027 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	CUL5	Q93034	780 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	VPS16	Q9H269	839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344		A0A1W2PPC4	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TNFSF4	P23510	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	JAK3	P52333	1124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	MTAP	Q13126	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ACOX1	Q15067	660 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	P3H1	Q32P28	736 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	SNX27	Q96L92	541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	TACR3	P29371	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	DGKQ	P52824	942 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	YPEL5	P62699	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CPEB4-210	ENST00000522344	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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