RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517088.1

RNU6-685P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 685, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-685P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRAMEF2O60811 474 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 GCATO75600 419 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 JTBO76095 146 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TJP3O95049 919 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ADRA1DP25100 572 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SLC5A2P31639 672 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 AKT1P31749 480 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TRAPPC10P48553 1259 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PROK1P58294 105 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TNFAIP2Q03169 654 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ATP1A4Q13733 1029 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 CLCA4Q14CN2 919 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ACOX1Q15067 660 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ST3GAL2Q16842 350 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ATG16L2Q8NAA4 619 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 STYXQ8WUJ0 223 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 LRFN1Q9P244 771 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 COL15A1P39059 1388 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 A8MVJ9 347 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TRIM38O00635 465 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PCDH17O14917 1159 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 CBFA2T3O75081 653 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ALADP13716 330 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 KLRK1P26718 216 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 GALNSP34059 522 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 GSTM5P46439 218 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SOX10P56693 466 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 GPC5P78333 572 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 MORC3Q14149 939 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SPARCL1Q14515 664 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 GRM4Q14833 912 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PFKFB4Q16877 469 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM65Q6PI78 240 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF788Q6ZQV5 615 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 CHSY1Q86X52 802 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 DDB2Q92466 427 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SNX18Q96RF0 628 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 WDR24Q96S15 920 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 VPS45Q9NRW7 570 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ASIC5Q9NY37 505 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TISP43B9A030 160 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 M0R3H8 397 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 FCHO1O14526 889 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 FYB1O15117 783 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 DNPH1O43598 174 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PPFIA2O75334 1257 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TAF5LO75529 589 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 CER1O95813 267 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 MT-CO3P00414 261 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 CYP2D6P10635 497 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PEPDP12955 493 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 GYS1P13807 737 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 CHKAP35790 457 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TFF2Q03403 129 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 SEMA3BQ13214 749 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 DENND2CQ68D51 928 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 CCDC174Q6PII3 467 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-685P-201ENST00000517088 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms