RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 NR1H3Q13133 447 aa19.61■□□□□ 0.73
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SH3BP2-218ENST00000511185 HTR3DQ70Z44 454 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM25Q86YD3 366 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB44Q8NCP5 570 aa19.61■□□□□ 0.73
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SH3BP2-218ENST00000511185 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP2-218ENST00000511185 TJP2Q9UDY2 1190 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP2-218ENST00000511185 FHOD1Q9Y613 1164 aa19.61■□□□□ 0.73
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SH3BP2-218ENST00000511185 OTUB2Q96DC9 234 aa19.6■□□□□ 0.73
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SH3BP2-218ENST00000511185 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa19.59■□□□□ 0.73
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SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa19.59■□□□□ 0.73
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SH3BP2-218ENST00000511185 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
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SH3BP2-218ENST00000511185 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
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SH3BP2-218ENST00000511185 FAM170AA1A519 330 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa19.58■□□□□ 0.72
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SH3BP2-218ENST00000511185 SCML4Q8N228 414 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 HHIPQ96QV1 700 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS16Q9H269 839 aa19.58■□□□□ 0.72
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SH3BP2-218ENST00000511185 CEP192Q8TEP8 1941 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa19.57■□□□□ 0.72
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SH3BP2-218ENST00000511185 TULP3O75386 442 aa19.57■□□□□ 0.72
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SH3BP2-218ENST00000511185 RPL34P49207 117 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
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SH3BP2-218ENST00000511185 RAPGEF1Q13905 1077 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 NCAPHQ15003 741 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf27AQ580R0 203 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC47A2Q86VL8 602 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 SUMF1Q8NBK3 374 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 USP33Q8TEY7 942 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 BBS2Q9BXC9 721 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP2-218ENST00000511185 PLCB1Q9NQ66 1216 aa19.57■□□□□ 0.72
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