RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC17Q96LX7 622 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIPOR3Q96MK2 946 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR24Q96S15 920 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.38□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNAB3O43448 404 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP1O94782 785 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR47O94967 919 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR35P0CG20 571 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM225BP0DP42 221 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MST1P26927 711 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPHB2P29323 1055 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC5A2P31639 672 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPC5P78333 572 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AWAT1Q58HT5 328 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAXCQ5TGI0 409 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEK8Q86SG6 692 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNT16Q8N428 558 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FNIP2Q9P278 1114 aa5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2W5A6NFC9 320 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CA12O43570 354 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRAMEF2O60811 474 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COQ9O75208 318 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GCATO75600 419 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDST3O95803 873 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PBX1P40424 430 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEK3P51956 506 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AK2P54819 239 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNASE1L3Q13609 305 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35G1Q2M3R5 365 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C4orf46Q504U0 113 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC181Q5TID7 509 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2C3Q8N628 320 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WASF1Q92558 559 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS50Q96JG6 964 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX27Q96L92 541 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS45Q9NRW7 570 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FZD4Q9ULV1 537 aa5.36□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM232C9JQI7 657 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KELP23276 732 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YY1P25490 414 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPS1Q13098 491 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNJ12Q14500 433 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC23BQ15437 767 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP9Q49MG5 647 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTX3Q5HYI7 312 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF626Q68DY1 528 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM65Q6PI78 240 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT73Q86Y46 540 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TXLNBQ8N3L3 684 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC138Q96M89 665 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGL1Q9NZL6 768 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.35□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM234BA2RU67 622 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLIC1O00299 241 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EGR1P18146 543 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PICALMQ13492 652 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP1A4Q13733 1029 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNB1Q14721 858 aa5.34□□□□□ -1.55
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.6 ms