RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 EMC10Q5UCC4 262 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RSPH3Q86UC2 560 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 OBP2AQ9NY56 170 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DNAH12Q6ZR08 3092 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 VWA8A3KMH1 1905 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KAT6AQ92794 2004 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ENPP3O14638 875 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TRAPPC3O43617 180 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CD48P09326 243 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 FOSL2P15408 326 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 IL1R2P27930 398 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ARSEP51690 589 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 GPS1Q13098 491 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TAF5Q15542 800 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CDO1Q16878 200 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CCDC89Q8N998 374 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 C12orf29Q8N999 325 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 HSPH1Q92598 858 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 EDAQ92838 391 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 HPDLQ96IR7 371 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 APOL6Q9BWW8 343 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KLC4Q9NSK0 619 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SETD4Q9NVD3 440 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SGK1O00141 431 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PIAS1O75925 651 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TJP3O95049 919 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TTC4O95801 387 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ERBB2P04626 1255 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CSF2RAP15509 400 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MAN1A1P33908 653 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RGS7P49802 495 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DSC1Q08554 894 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 GRM1Q13255 1194 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RAB6CQ53S08 254 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ARL10Q8N8L6 244 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SLCO2A1Q92959 643 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PGM2Q96G03 612 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CASD1Q96PB1 797 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.243e-7■■□□□ 13.6
HERC4-211ENST00000492996 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 LIASO43766 372 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 LILRB5O75023 590 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 BANF1O75531 89 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TDGF1P13385 188 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 EPHA5P54756 1037 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 NRLP54845 237 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TMEM132DQ14C87 1099 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DBN1Q16643 649 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 AMHR2Q16671 573 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 GNASQ5JWF2 1037 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KIF12Q96FN5 646 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CALN1Q9BXU9 219 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CEP350Q5VT06 3117 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 EPOPA6NHQ4 379 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PPEF2O14830 753 aa7.31□□□□□ -1.24
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