RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPC24	Q8NBT2	197 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LPP	Q93052	612 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCLT1	Q96NL6	688 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM5	Q9C035	493 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	IPP	Q9Y573	584 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EVPL	Q92817	2033 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF233	A6NK53	670 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	N4BP3	O15049	544 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA0355	O15063	1070 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAND2	O75155	1236 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS6KA5	O75582	802 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RECQL4	O94761	1208 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNA14	O95837	355 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EFEMP2	O95967	443 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERPINC1	P01008	464 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GYPC	P04921	128 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLTA	P09496	248 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCP2	P22307	547 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PON1	P27169	355 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FMO5	P49326	533 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GATM	P50440	423 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CORO7	P57737	925 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC42EP1	Q00587	391 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAPTM5	Q13571	262 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZACN	Q401N2	412 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	JADE1	Q6IE81	842 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	6.61	□□□□□ -1.35	2e-9	■■■□□ 17
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RSPH3	Q86UC2	560 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM139	Q8IV31	216 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAGE1	Q8TC20	777 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPF3	Q92784	378 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFSD3	Q96ES6	412 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASIC4	Q96FT7	647 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNX27	Q96L92	541 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CGRRF1	Q99675	332 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAM2	Q99965	735 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCHP	Q9BT92	498 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR88	Q9GZN0	384 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDIP1	Q9H305	208 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIPK3	Q9H422	1215 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	6.61	□□□□□ -1.35	2e-26	■□□□□ 9.2
RABGGTB-212	ENST00000491266	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0U1RQF3	1178 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PQC6	194 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FITM1	A5D6W6	292 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266		F8W810	466 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PMM2	O15305	246 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF623	O75123	536 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERLIN2	O94905	339 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CALCA	P01258	141 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DRA	P01903	254 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLTB	P09497	229 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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