RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3-208ENST00000489537 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.64□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PADI3Q9ULW8 664 aa6.64□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PHF24Q9UPV7 400 aa6.64□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.64□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.64□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CDC14CA4D256 554 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MYADML2A6NDP7 307 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ARL5CA6NH57 179 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 HACD1B0YJ81 288 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 E5RJQ4 531 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 M0QZQ0 153 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ARVCFO00192 962 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 AP3B1O00203 1094 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 DNM1LO00429 736 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SYN3O14994 580 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 GRIN2DO15399 1336 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MTSS1O43312 755 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 LIASO43766 372 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 LRCH4O75427 683 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 DAB1O75553 588 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SPAG6O75602 509 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ENDOD1O94919 500 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 KRT14P02533 472 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CHRNA1P02708 482 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SELPP16109 830 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 KDELR1P24390 212 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 NOS2P35228 1153 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PHBP35232 272 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PTGIRP43119 386 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RAP1GAPP47736 663 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PLTPP55058 493 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 LTBP2Q14767 1821 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TERF2Q15554 542 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ABI1Q8IZP0 508 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SEPT8Q92599 483 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PGM2Q96G03 612 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 BTBD6Q96KE9 485 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ADAM2Q99965 735 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SYT15Q9BQS2 421 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MED10Q9BTT4 135 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 COMMD8Q9NX08 183 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 EHD2Q9NZN4 543 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 VPS18Q9P253 973 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 EVPLQ92817 2033 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SLC35F4A4IF30 521 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 C9IYK1 514 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 H3BRJ5 948 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 H7C4K7 107 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PTGESO14684 152 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 APOL1O14791 398 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CAPN9O14815 690 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 EFCAB14O75071 495 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TCEA3O75764 348 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 B3GAT3O94766 335 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 AGTP01019 485 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ABHD2P08910 425 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SLC2A3P11169 496 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MIPP30301 263 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SERPINB6P35237 376 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 GJC1P36383 396 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 HSD17B3P37058 310 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MLH1P40692 756 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MARCKSL1P49006 195 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 HCAR3P49019 387 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 GUCY2FP51841 1108 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CDH6P55285 790 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ARL4CP56559 192 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 BCAR1P56945 870 aa6.62□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TAS2R40P59535 323 aa6.62□□□□□ -1.35
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