RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484396.1

ACSS1-204, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACSS1, Length 4,767 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-204ENST00000484396 SAGE2PA6NJ88 616 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ALOX12P18054 663 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RPL26P61254 145 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SWSAP1Q6NVH7 229 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ATL1Q8WXF7 558 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 VPS35Q96QK1 796 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RRAGCQ9HB90 399 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 GABBR1Q9UBS5 961 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TTLL3Q9Y4R7 772 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SPDYE2BA6NHP3 402 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 MYO1DO94832 1006 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 IFNA14P01570 189 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SHBGP04278 402 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SPDYE6P0CI01 402 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SCYL2Q6P3W7 929 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 DENND6AQ8IWF6 608 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 HELQQ8TDG4 1101 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RUBCNLQ9H714 662 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 FAM8A1Q9UBU6 413 aa13.14□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CLIC2O15247 247 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RARGP13631 454 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RAG1P15918 1043 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ANXA13P27216 316 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 QARSP47897 775 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RASA2Q15283 850 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 OR6J1Q8NGC5 347 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ZDHHC15Q96MV8 337 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TRIM51Q9BSJ1 452 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CLDN25C9JDP6 229 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TOMM70O94826 608 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PCSK7Q16549 785 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ARL13BQ3SXY8 428 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 LVRNQ6Q4G3 990 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 C3orf67Q6ZVT6 689 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PHC2Q8IXK0 858 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 THNSL1Q8IYQ7 743 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 NDUFAF2Q8N183 169 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RIN3Q8TB24 985 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CLIP3Q96DZ5 547 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 MSTO1Q9BUK6 570 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 DCLK3Q9C098 648 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 KMOO15229 486 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 NCAM2O15394 837 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 APOL3O95236 402 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 P4HBP07237 508 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 GLI1P08151 1106 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RHAGQ02094 409 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 VAC14Q08AM6 782 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 LLGL1Q15334 1064 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SNX31Q8N9S9 440 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 FBXL13Q8NEE6 735 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 OXER1Q8TDS5 423 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ARMC1Q9NVT9 282 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TMEM260Q9NX78 707 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 VANGL2Q9ULK5 521 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 NADKO95544 446 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RASA1P20936 1047 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SLC9A5Q14940 896 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 NEDD8Q15843 81 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 SHC4Q6S5L8 630 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 UBASH3BQ8TF42 649 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RETREG1Q9H6L5 497 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 TFR2Q9UP52 801 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 AURKCQ9UQB9 309 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 HEY1Q9Y5J3 304 aa13.13□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 PPLO60437 1756 aa13.12□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 MYPNQ86TC9 1320 aa13.12□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 GTF2H1P32780 548 aa13.12□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ALDH1A3P47895 512 aa13.12□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 CCT8P50990 548 aa13.12□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RAD23AP54725 363 aa13.12□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 RELAQ04206 551 aa13.12□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 EPC2Q52LR7 807 aa13.12□□□□□ -0.31
ACSS1-204ENST00000484396 ALLCQ8N6M5 410 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms