RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF112Q9UJU3 913 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MYH4Q9Y623 1939 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ZAR1LA6NP61 321 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 F5H6K3 240 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 K7ESF4 209 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB43O43298 467 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ERN1O75460 977 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TOMM70O94826 608 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GPANK1O95872 356 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL1O95922 423 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ASNSP08243 561 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ELANEP08246 267 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TOP1P11387 765 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FGFR4P22455 802 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GCSHP23434 173 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 LIFRP42702 1097 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SNAP25P60880 206 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HSD11B2P80365 405 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CREMQ03060 361 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KLRC3Q07444 240 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 GRM1Q13255 1194 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MTM1Q13496 603 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 APOA5Q6Q788 366 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 DGKHQ86XP1 1220 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 OR2I1PQ8NGU4 316 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NRG4Q8WWG1 115 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 AGXT2Q9BYV1 514 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 UBA5Q9GZZ9 404 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 VAT1LQ9HCJ6 419 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SYBUQ9NX95 663 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SLC5A4Q9NY91 659 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0355O15063 1070 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 JAK2O60674 1132 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PFKFB2O60825 505 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHA8P1O95397 391 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CTDNEP1O95476 244 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFB10O96000 172 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 DDCP20711 480 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FDXRP22570 491 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SLC16A2P36021 539 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SEC24CP53992 1094 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HMGCS2P54868 508 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 HUNKP57058 714 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CXADRP78310 365 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 TROAPQ12815 778 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 MPP3Q13368 585 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ACAP2Q15057 778 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD1Q15327 319 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC96Q2M329 555 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ODR4Q5SWX8 454 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 FANCBQ8NB91 859 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ANKS1AQ92625 1134 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 PHKBQ93100 1093 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 SNX21Q969T3 373 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 OPTNQ96CV9 577 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 NYAP2Q9P242 653 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 USP25Q9UHP3 1055 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 INTUQ9ULD6 942 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRC-211ENST00000484135 DOCK1Q14185 1865 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PASKQ96RG2 1323 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 OTOFQ9HC10 1997 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 PLIN4Q96Q06 1357 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CDHR4A6H8M9 788 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 ALG1L2C9J202 215 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM232C9JQI7 657 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 CPLX1O14810 134 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-211ENST00000484135 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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