RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482419.1

FAM208B-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, human

TSL 2

Gene FAM208B, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208B-208	ENST00000482419	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	GJA10	Q969M2	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	WDR24	Q96S15	920 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CA12	O43570	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CELA2A	P08217	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	HSPA7	P48741	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	DGKQ	P52824	942 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	BTK	Q06187	659 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	DDB2	Q92466	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	PODXL	O00592	558 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	PLA2G6	O60733	806 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	USP1	O94782	785 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CYP2D6	P10635	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	ABCB4	P21439	1286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CERS1	P27544	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	PBX1	P40424	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	GPC5	P78333	572 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	VIP	P01282	170 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TUBB4A	P04350	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	RAB30	Q15771	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	CLIC1	O00299	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	PPP6C	O00743	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	FYB1	O15117	783 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	DRD1	P21728	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	EPHB2	P29323	1055 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	MPG	P29372	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	SERPINB3	P29508	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	HTR3A	P46098	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	KCNB1	Q14721	858 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM208B-208	ENST00000482419	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms