RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 DNM3Q9UQ16 869 aa8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 TRIM66O15016 1216 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 AGFG2O95081 481 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PIGRP01833 764 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 MPOP05164 745 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CKMP06732 381 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PLA2G4BP0C869 781 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CSH1P0DML2 217 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CSH2P0DML3 217 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ODC1P11926 461 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CKMT2P17540 419 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ABCB4P21439 1286 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CASRP41180 1078 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 LIG4P49917 911 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CBX1P83916 185 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 MESP2Q0VG99 397 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 DNAJC3Q13217 504 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 IGFBP7Q16270 282 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 HYIQ5T013 277 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SPATA1Q5VX52 437 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 WSCD1Q658N2 575 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 FSIP1Q8NA03 581 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 FAM212AQ96EL1 285 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SGF29Q96ES7 293 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 NUP58Q9BVL2 599 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 A0A0B4J269 797 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 A0A1B0GTQ1 180 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 A0A1W2PQF6 199 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 H0Y8X5 98 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PIRO00625 290 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 OGTO15294 1046 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ADH1CP00326 375 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CYP11A1P05108 521 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PTMAP06454 111 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ADRB2P07550 413 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CYP3A5P20815 502 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PAX3P23760 479 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PRPHP41219 470 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ACOT2P49753 483 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF132P52740 706 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PDIA5Q14554 519 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 FHL5Q5TD97 284 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 OSTM1Q86WC4 334 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 GPBP1Q86WP2 473 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CHPFQ8IZ52 775 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 EXTL1Q92935 676 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 HPS3Q969F9 1004 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PKMYT1Q99640 499 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 EPN3Q9H201 632 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 USP25Q9UHP3 1055 aa8.36□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 ITPR3Q14573 2671 aa8.35□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.35□□□□□ -1.07
SZRD1-208ENST00000476423 GFRA2O00451 464 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms