RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959		F8VZ95	297 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM24	O15164	1050 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF40	O75150	1001 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	FYN	P06241	537 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SP9	P0CG40	484 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	RALA	P11233	206 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADH5	P11766	374 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	UCHL3	P15374	230 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSEN1	P49768	467 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DMWD	Q09019	674 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDCL	Q13371	301 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC32	Q14392	662 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM25	Q86YD3	366 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCML4	Q8N228	414 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD101	Q93033	1021 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	NELL2	Q99435	816 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MIS12	Q9H081	205 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCAM2	O15394	837 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	LAMTOR5	O43504	91 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	LTF	P02788	710 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NBL1	P41271	181 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAGEA9	P43362	315 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYCP1	Q15431	976 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MEA1	Q16626	185 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	BHMT	Q93088	406 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSFY1	Q96LI6	401 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959		K7ESF4	209 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADH1C	P00326	375 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERBB2	P04626	1255 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEC13	P55735	322 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	JAM2	P57087	298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	IQCB1	Q15051	598 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAF5	Q15542	800 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	OTUB2	Q96DC9	234 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM81B	Q96LP2	452 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLK2	Q9NYY3	685 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959		K7EQS6	105 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEX33	O43247	280 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MED7	O43513	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TULP3	O75386	442 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP11B1	P15538	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRE11	P49959	708 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SGSH	P51688	502 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANO4	Q32M45	955 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2CD6	Q53TS8	623 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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