RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MYO1C	O00159	1063 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	KIAA0355	O15063	1070 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	BUB1	O43683	1085 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	BNIP3L	O60238	219 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SPAG6	O75602	509 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DIRAS3	O95661	229 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CFB	P00751	764 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GALT	P07902	379 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	EDN3	P14138	238 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ANPEP	P15144	967 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	C5AR1	P21730	350 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TM4SF1	P30408	202 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PSMD7	P51665	324 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GPX6	P59796	221 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	VBP1	P61758	197 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ASIC1	P78348	528 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	XIAP	P98170	497 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ATP8B2	P98198	1209 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PPAT	Q06203	517 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	RALGDS	Q12967	914 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	IL24	Q13007	206 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DUSP4	Q13115	394 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	XRCC4	Q13426	336 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	AOC3	Q16853	763 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC142	Q17RM4	750 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	UBXN11	Q5T124	520 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CEP57	Q86XR8	500 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CADM3	Q8N126	398 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MPP5	Q8N3R9	675 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NEK11	Q8NG66	645 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	STYX	Q8WUJ0	223 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NCSTN	Q92542	709 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	IP6K1	Q92551	441 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MR1	Q95460	341 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MNT	Q99583	582 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	COQ7	Q99807	217 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TSG101	Q99816	390 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SH3GL2	Q99962	352 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC77	Q9BR77	488 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	GSX2	Q9BZM3	304 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	IGFLR1	Q9H665	355 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	BRD7	Q9NPI1	651 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	VPS18	Q9P253	973 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	AKT3	Q9Y243	479 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DERA	Q9Y315	318 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	DENND3	A2RUS2	1198 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SMIM30	A4D0T7	59 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM247	A6NEH6	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398		A8MXE2	369 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398		E9PBE3	544 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	NDUFS8	O00217	210 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
TTC3-214	ENST00000472398	SYT5	O00445	386 aa		3.37	□□□□□ -1.87

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