RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468837.1

STXBP4-208, Transcript of syntaxin binding protein 4, human

TSL 2

Gene STXBP4, Length 690 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STXBP4-208	ENST00000468837	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.7	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	NPHP1	O15259	732 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CCP110	O43303	1012 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	GCAT	O75600	419 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	USP1	O94782	785 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	FGFR2	P21802	821 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PTGER1	P34995	402 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TEC	P42680	631 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	MTHFS	P49914	203 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ITGA8	P53708	1063 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ELF2	Q15723	593 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	SNX22	Q96L94	193 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.69	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837		M0R3H8	397 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	MOSPD3	O75425	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	MMP13	P45452	471 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TIRAP	P58753	221 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ICA1	Q05084	483 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	STARD3	Q14849	445 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	NPY5R	Q15761	445 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CCT6B	Q92526	530 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	RAB27B	O00194	218 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	FFAR2	O15552	330 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	SH3BP5	O60239	455 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PLA2G6	O60733	806 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PIAS2	O75928	621 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	MT-CO3	P00414	261 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	MT-ND5	P03915	603 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	HGF	P14210	728 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CREB1	P16220	341 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	IL1R2	P27930	398 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	GRK6	P43250	576 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	GATM	P50440	423 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	LMAN2	Q12907	356 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	GGT6	Q6P531	493 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.67	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	EXOC5	O00471	708 aa		4.66	□□□□□ -1.66
STXBP4-208	ENST00000468837	PPEF2	O14830	753 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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