RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT5P13647 590 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF18P17022 549 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RFX1P22670 979 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNAR2P48551 515 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBP50607 506 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 BCAT1P54687 386 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPN5P54829 565 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DAOAP59103 153 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CETN1Q12798 172 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PDGFRLQ15198 375 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 EMC10Q5UCC4 262 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZNB5 142 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 HTR3DQ70Z44 454 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NAT16Q8N8M0 369 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SHC3Q92529 594 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 EDEM1Q92611 657 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM122AQ96E09 287 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NELL2Q99435 816 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GANQ9H2C0 597 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 EHD2Q9NZN4 543 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EQS6 105 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 K7ESF4 209 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX33O43247 280 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP12O43422 761 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MBD3O95983 291 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SETSIPP0DME0 302 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GNA15P30679 374 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 EFEMP1Q12805 493 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TAF5Q15542 800 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 STX1AQ16623 288 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC47A2Q86VL8 602 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MIB1Q86YT6 1006 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PASD1Q8IV76 773 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF276Q8N554 614 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NELL1Q92832 810 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CD101Q93033 1021 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP2A3Q93084 1043 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MIS12Q9H081 205 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-206ENST00000461017 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GON4LQ3T8J9 2241 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMA1P25391 3075 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CKAP5Q14008 2032 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC12A8A0AV02 714 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 E5RJQ4 531 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NCAM2O15394 837 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF40O75150 1001 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NFATC1O95644 943 aa7.34□□□□□ -1.23
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