RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445181.5

C9orf3-207, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 873 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-207ENST00000445181 GFPT2O94808 682 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 CYP11B1P15538 503 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 DAOAP59103 153 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 EFEMP1Q12805 493 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 MTAPQ13126 283 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 SCML4Q8N228 414 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 STK32AQ8WU08 396 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 IRGQQ8WZA9 623 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 NOX5Q96PH1 765 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 CHRDQ9H2X0 955 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 TSPY26PQ9H489 355 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 HPS4Q9NQG7 708 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 F5P12259 2224 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 YJEFN3A6XGL0 299 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 E7ENQ6 273 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 GABBR2O75899 941 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 STAT1P42224 750 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 PDCLQ13371 301 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 EML3Q32P44 896 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 ZNF528Q3MIS6 628 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 TAF3Q5VWG9 929 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 BSPRYQ5W0U4 402 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 BHLHA9Q7RTU4 235 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 ZNF276Q8N554 614 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 RNF139Q8WU17 664 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 LHX5Q9H2C1 402 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 ABCC13Q9NSE7 274 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 CYTH4Q9UIA0 394 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.09■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 A0A1B0GTH6 734 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 E2F8A0AVK6 867 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 NFATC1O95644 943 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 CHRNB1P11230 501 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 CTHP32929 405 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 SOX5P35711 763 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 JAM2P57087 298 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 NR1H3Q13133 447 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 SCUBE3Q8IX30 993 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 CLEC4CQ8WTT0 213 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 EDEM1Q92611 657 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 SLC4A5Q9BY07 1137 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 ECT2Q9H8V3 914 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 TBC1D14Q9P2M4 693 aa25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
C9orf3-207ENST00000445181 E5RJQ4 531 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 SART1O43290 800 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 LMNAP02545 664 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 RPL34P49207 117 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 FANCCQ00597 558 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 AMPD2Q01433 879 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 TXNDC11Q6PKC3 985 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 SYNCQ9H7C4 482 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 MARCH2Q9P0N8 246 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 LTFP02788 710 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 SNX16P57768 344 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 COG7P83436 770 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 TSSK4Q6SA08 328 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 TMEM110Q86TL2 294 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 TMEM35BQ8NCS4 154 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 FAM149B1Q96BN6 582 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 IER2Q9BTL4 223 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 USP34Q70CQ2 3546 aa25.06■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 HMBSP08397 361 aa25.05■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 ARID5AQ03989 594 aa25.05■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 LRRC32Q14392 662 aa25.05■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 MAMSTRQ6ZN01 415 aa25.05■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.05■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 WBP2Q969T9 261 aa25.05■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 A0A1W2PQC6 194 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 SLC12A8A0AV02 714 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 UBASH3AP57075 661 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 NR1I3Q14994 352 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 PON2Q15165 354 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 ZNF677Q86XU0 584 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 OTUB2Q96DC9 234 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 CPXM1Q96SM3 734 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 ZSCAN32Q9NX65 697 aa25.04■■□□□ 1.6
C9orf3-207ENST00000445181 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms