RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 IMPG2Q9BZV3 1241 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SMYD3Q9H7B4 428 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SMPD4Q9NXE4 827 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PCNX2A6NKB5 2137 aa12.34□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 F8VP50 259 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 MAPK13O15264 365 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 ATP2C2O75185 946 aa12.33□□□□□ -0.44
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PRAME-210ENST00000442481 VNN1O95497 513 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 OAS1P00973 400 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 HLA-DRAP01903 254 aa12.33□□□□□ -0.44
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PRAME-210ENST00000442481 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 TUBP50607 506 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 STX17P56962 302 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 LRRC63Q05C16 580 aa12.33□□□□□ -0.44
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PRAME-210ENST00000442481 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 TAF10Q12962 218 aa12.33□□□□□ -0.44
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PRAME-210ENST00000442481 E2F5Q15329 346 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 STX1AQ16623 288 aa12.33□□□□□ -0.44
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PRAME-210ENST00000442481 CCDC40Q4G0X9 1142 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 COBLL1Q53SF7 1204 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 MDH1BQ5I0G3 518 aa12.33□□□□□ -0.44
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PRAME-210ENST00000442481 CCDC150Q8NCX0 1101 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 TMEM174Q8WUU8 243 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 FUCA2Q9BTY2 467 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 NACA2Q9H009 215 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 TSPY26PQ9H489 355 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 CRTAC1Q9NQ79 661 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 PTPRDP23468 1912 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 CACNA1EQ15878 2313 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 GON4LQ3T8J9 2241 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 FAM221BA6H8Z2 402 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP33O14559 1287 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 IKBKBO14920 756 aa12.32□□□□□ -0.44
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PRAME-210ENST00000442481 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 P4HA1P13674 534 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 HOXB2P14652 356 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 ITPKAP23677 461 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 NTSR1P30989 418 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R2P41236 205 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 CDH8P55286 799 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 USP46P62068 366 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 CLDN10P78369 228 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 ZNF33AQ06730 810 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 PPP3CAQ08209 521 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 ZACNQ401N2 412 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 C1orf220Q5T0J3 134 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 HECTD3Q5T447 861 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 MINDY1Q8N5J2 469 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 TRIML1Q8N9V2 468 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 TAS1R2Q8TE23 839 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 FOXJ1Q92949 421 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 FBXO32Q969P5 355 aa12.32□□□□□ -0.44
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PRAME-210ENST00000442481 RNF38Q9H0F5 515 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 XYLT2Q9H1B5 865 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 DPEP3Q9H4B8 488 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 TMEM74BQ9NUR3 256 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 COMMD8Q9NX08 183 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 KLK13Q9UKR3 277 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 BICDL2A1A5D9 508 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 STX10O60499 249 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 NDUFS2O75306 463 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 STAU1O95793 577 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 BMP6P22004 513 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 SLC6A11P48066 632 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 MXI1P50539 228 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 ZXDBP98169 803 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-210ENST00000442481 PAK1Q13153 545 aa12.31□□□□□ -0.44
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