RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-210	ENST00000440825	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-210	ENST00000440825	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-210	ENST00000440825	EDEM1	Q92611	657 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-210	ENST00000440825	BBS2	Q9BXC9	721 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-210	ENST00000440825	THAP9	Q9H5L6	903 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC12A8	A0AV02	714 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	HR	O43593	1189 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	USP8	P40818	1118 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF132	P52740	706 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	COG7	P83436	770 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	DMC1	Q14565	340 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	PKDCC	Q504Y2	493 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	CEP68	Q76N32	757 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	USP33	Q8TEY7	942 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	TIE1	P35590	1138 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	GRIA2	P42262	883 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	MFAP3	P55082	362 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	PMF1	Q6P1K2	205 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	SYT13	Q7L8C5	426 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF276	Q8N554	614 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	GPT2	Q8TD30	523 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	RNF139	Q8WU17	664 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	DEC1	Q9P2X7	70 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM186A	A6NE01	2351 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825		E7ENQ6	273 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	TULP3	O75386	442 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	MAN2A1	Q16706	1144 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ST7	Q9NRC1	585 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	TRIM24	O15164	1050 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	TYR	P14679	529 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	EMC10	Q5UCC4	262 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825		Q6ZNB5	142 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ALLC	Q8N6M5	410 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	MIS12	Q9H081	205 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	PLK2	Q9NYY3	685 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	THAP12	O43422	761 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	KLKB1	P03952	638 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	PON1	P27169	355 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	HOXA6	P31267	233 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	CNR2	P34972	360 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	DAOA	P59103	153 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	DENND1C	Q8IV53	801 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	DCLK3	Q9C098	648 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ACP6	Q9NPH0	428 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	APBB3	O95704	486 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	GNA15	P30679	374 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM81B	Q96LP2	452 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-210	ENST00000440825	AXIN1	O15169	862 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAAP20-210	ENST00000440825	MED7	O43513	233 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAAP20-210	ENST00000440825	GABBR2	O75899	941 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAAP20-210	ENST00000440825	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
FAAP20-210	ENST00000440825	VWA3B	Q502W6	1294 aa		29.01	■■■□□ 2.23

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