RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TLR10Q9BXR5 811 aa17.67■□□□□ 0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP17.65■□□□□ 0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 NME3Q13232 169 aa17.65■□□□□ 0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 BOLA3Q53S33 107 aa17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAC4Q86UU9 113 aa17.65■□□□□ 0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HS6ST3Q8IZP7 471 aa17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAM33Q9BZ11 813 aa17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNMT3LQ9UJW3 386 aa17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX12Q9UMY4 172 aa17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTCH2Q9Y6C9 303 aa17.65■□□□□ 0.42
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MYL4P12829 197 aa17.64■□□□□ 0.41
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TCP1P17987 556 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXCR3P49682 368 aa17.64■□□□□ 0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 PEX5P50542 639 aa17.64■□□□□ 0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 RWDD2BP57060 319 aa17.64■□□□□ 0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM10P98175 930 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa17.64■□□□□ 0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCYL2Q6P3W7 929 aa17.64■□□□□ 0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAREM2Q75VX8 874 aa17.64■□□□□ 0.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
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