RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 NT5MQ9NPB1 228 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 TM9SF1O15321 606 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ADIGQ0VDE8 80 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 LAYNQ6UX15 382 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF333Q96JL9 665 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 TLR10Q9BXR5 811 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 NFASCO94856 1347 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 NR2C2P49116 596 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 PPIL2Q13356 520 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 STX19Q8N4C7 294 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SPASTQ9UBP0 616 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 MYO1GB0I1T2 1018 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 TBC1D12O60347 775 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 GLP2RO95838 553 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 AVPR1AP37288 418 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CPA2P48052 419 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF284Q2VY69 593 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ECSITQ9BQ95 431 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SOX13Q9UN79 622 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 LGALS2P05162 132 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 BATF3Q9NR55 127 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 GHRP10912 638 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SERPINB10P48595 397 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 RENBPP51606 427 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CDH17Q12864 832 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 RETSATQ6NUM9 610 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 NT5DC3Q86UY8 548 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 IL1RL2Q9HB29 575 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SERPINF2P08697 491 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ILDR2Q71H61 639 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SERPINB11Q96P15 392 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 TRHDEQ9UKU6 1024 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 O00370 1275 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 MEIS2O14770 477 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ARIH2O95376 493 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 PRKCIP41743 596 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 NUDT2P50583 147 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 TBX4P57082 545 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC6A3Q01959 620 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 PYGMP11217 842 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CPA3P15088 417 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 VGLL4Q14135 290 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CBWD6Q4V339 395 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SEL1L3Q68CR1 1132 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 TMC7Q7Z402 723 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 EDEM1Q92611 657 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 HAS1Q92839 578 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SEMA4AQ9H3S1 761 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 GPAMQ9HCL2 828 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 RIC1Q4ADV7 1423 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 RAMP2O60895 175 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 GTF2BQ00403 316 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 GRIK5Q16478 980 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 OOSP2Q86WS3 158 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 PRKD2Q9BZL6 878 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 GANQ9H2C0 597 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 CBX4O00257 560 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-203ENST00000409212 EFCAB14O75071 495 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms