RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 OGFRQ9NZT2 677 aa6.33□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.33□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.33□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.33□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TRIP11Q15643 1979 aa6.33□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.32□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.32□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.32□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 EOMESO95936 686 aa6.32□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 GPNMBQ14956 572 aa6.32□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.32□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TBCELQ5QJ74 424 aa6.32□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 TTC27Q6P3X3 843 aa6.32□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.32□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.32□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 UROC1Q96N76 676 aa6.32□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 MCEEQ96PE7 176 aa6.32□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 HMX2A2RU54 273 aa6.31□□□□□ -1.4
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C6orf48-208ENST00000395788 A8MXQ7 604 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF487B1APH4 448 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 E5RJQ4 531 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 TULP2O00295 520 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 CYB561D2O14569 222 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 HCRTO43612 131 aa6.31□□□□□ -1.4
C6orf48-208ENST00000395788 LRCH4O75427 683 aa6.31□□□□□ -1.4
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