RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 GPT2Q8TD30 523 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 HHIPQ96QV1 700 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PNKPQ96T60 521 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NUP205Q92621 2012 aa8.05□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 M0QYV0 167 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TULP2O00295 520 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 HRO43593 1189 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 GREM1O60565 184 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 APBB3O95704 486 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ZBED1O96006 694 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 APODP05090 189 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PAEPP09466 180 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 VDRP11473 427 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G4AP47712 749 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ID4P47928 161 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A11P48066 632 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 GAD2Q05329 585 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ADIGQ0VDE8 80 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 EFEMP1Q12805 493 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 DMC1Q14565 340 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ANO4Q32M45 955 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf27AQ580R0 203 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 HTR3DQ70Z44 454 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CEP68Q76N32 757 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RRAGAQ7L523 313 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM25Q86YD3 366 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF276Q8N554 614 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 UBA3Q8TBC4 463 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 USP33Q8TEY7 942 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 GAB3Q8WWW8 586 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KAT5Q92993 513 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ULBP1Q9BZM6 244 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 THADAQ6YHU6 1953 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ANTXRLA6NF34 631 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CACNG3O60359 315 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TULP3O75386 442 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 STC2O76061 302 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TPM2P07951 284 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KRT5P13647 590 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TYRP14679 529 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 GRIA2P42262 883 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF4P43489 277 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF132P52740 706 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 STILQ15468 1287 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PKDCCQ504Y2 493 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZNB5 142 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 ALLCQ8N6M5 410 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 NAT16Q8N8M0 369 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TERB1Q8NA31 727 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 TFAP2BQ92481 460 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-201ENST00000361543 MED15Q96RN5 788 aa8.03□□□□□ -1.12
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