RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 LY6G5CQ5SRR4 150 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 HTR3DQ70Z44 454 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 C12orf40Q86WS4 652 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf210Q8IVY1 113 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 MARCH2Q9P0N8 246 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D14Q9P2M4 693 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGC3Q9UN70 934 aa28.27■■■□□ 2.12
TPGS1-201ENST00000359315 FAM170AA1A519 330 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 E5RJQ4 531 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 EGFP01133 1207 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 MESP2Q0VG99 397 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 Q6ZNB5 142 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 SCUBE3Q8IX30 993 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 PHOX2BQ99453 314 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 P2RY13Q9BPV8 354 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 STK33Q9BYT3 514 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 CBX8Q9HC52 389 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 NLRC4Q9NPP4 1024 aa28.26■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 WDFY4Q6ZS81 3184 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 SLC12A8A0AV02 714 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 ANTXRLA6NF34 631 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 SMTNL1A8MU46 457 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 TEX33O43247 280 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 CYP11B1P15538 503 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 PKN3Q6P5Z2 889 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 STK32AQ8WU08 396 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 IRGQQ8WZA9 623 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 P2RY11Q96G91 374 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 CPXM1Q96SM3 734 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 C2orf42Q9NWW7 574 aa28.25■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 MSI1O43347 362 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 LTFP02788 710 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 FYNP06241 537 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEA9P43362 315 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 SLC6A11P48066 632 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 NR1H3Q13133 447 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 TAF3Q5VWG9 929 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 LUZP1Q86V48 1076 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM25Q86YD3 366 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 CD101Q93033 1021 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 ERGIC2Q96RQ1 377 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC13Q9NSE7 274 aa28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO21O94952 628 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 ADH5P11766 374 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 JAM2P57087 298 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA8FQ08AF8 430 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC32Q14392 662 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 SMYD5Q6GMV2 418 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM110Q86TL2 294 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 FMNL3Q8IVF7 1028 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 SFTPA1Q8IWL2 248 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 RNF139Q8WU17 664 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 OTUB2Q96DC9 234 aa28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 MIA3Q5JRA6 1907 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 GFPT2O94808 682 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 HOXC13P31276 330 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 ACADSBP45954 432 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 AMPD2Q01433 879 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 DGKKQ5KSL6 1271 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 TSSK4Q6SA08 328 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 EPS8L1Q8TE68 723 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 LHX5Q9H2C1 402 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 SPHK2Q9NRA0 654 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 STRIP2Q9ULQ0 834 aa28.22■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 ADH1CP00326 375 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 ERBB2P04626 1255 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 KRT9P35527 623 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 COG7P83436 770 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 TAF5Q15542 800 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 PTPN20Q4JDL3 420 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 MSANTD2Q6P1R3 559 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 SLC20A1Q8WUM9 679 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 FAM149B1Q96BN6 582 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa28.21■■■□□ 2.11
TPGS1-201ENST00000359315 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TPGS1-201ENST00000359315 LAMTOR5O43504 91 aa28.2■■■□□ 2.1
TPGS1-201ENST00000359315 MMEP08473 750 aa28.2■■■□□ 2.1
TPGS1-201ENST00000359315 PLA2G5P39877 138 aa28.2■■■□□ 2.1
TPGS1-201ENST00000359315 BPIFB4P59827 614 aa28.2■■■□□ 2.1
TPGS1-201ENST00000359315 SATB1Q01826 763 aa28.2■■■□□ 2.1
TPGS1-201ENST00000359315 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TPGS1-201ENST00000359315 TPGS1Q6ZTW0 290 aa28.2■■■□□ 2.1
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