RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 C2CD2Q9Y426 696 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 MDM4O15151 490 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 VHLP40337 213 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC6A3Q01959 620 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 C12orf29Q8N999 325 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 MECRQ9BV79 373 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.28■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K6O95382 1288 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX16P57768 344 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 RCN1Q15293 331 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 CHI3L2Q15782 390 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ACSBG2Q5FVE4 666 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 PMF1Q6P1K2 205 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 STMN2Q93045 179 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 FGD4Q96M96 766 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 WWP1Q9H0M0 922 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF487B1APH4 448 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 TOMM70O94826 608 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 BMPR2Q13873 1038 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 CA9Q16790 459 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 AFG1LQ8WV93 481 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ACAP3Q96P50 834 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ZFATQ9P243 1243 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ARMCX1Q9P291 453 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 CSADQ9Y600 493 aa22.27■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SERPINB9P50453 376 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SESN3P58005 492 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CDK18Q07002 472 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 KCTD2Q14681 263 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ANO7Q6IWH7 933 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 A6NHS1 94 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM159BA6NKW6 160 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 A8MXQ7 604 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 GCATO75600 419 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CSH1P0DML2 217 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CSH2P0DML3 217 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 INSRRP14616 1297 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CRHR1P34998 444 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PGM1P36871 562 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGEA3P43357 314 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 OCRLQ01968 901 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC34A1Q06495 639 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM110Q86TL2 294 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SESTD1Q86VW0 696 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TMPRSS6Q8IU80 811 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 AKT3Q9Y243 479 aa22.26■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 UGT1A9O60656 530 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PSMG1O95456 288 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 SETSIPP0DME0 302 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TPSB2P20231 275 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CYP2F1P24903 491 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TTLL4Q14679 1199 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 TPSAB1Q15661 275 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 B2RBV5 119 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 BIRC5O15392 142 aa22.25■■□□□ 1.15
PTDSS1-201ENST00000337004 CNMDO75829 334 aa22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms