RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CD48P09326 243 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 PGFP49763 221 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 DCAF6Q58WW2 860 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FAM172AQ8WUF8 416 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 EDEM1Q92611 657 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CES2O00748 559 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RNF8O76064 485 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TUBBP07437 444 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RALAP11233 206 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 NAT1P18440 290 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ACADSBP45954 432 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 IRAK1P51617 712 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 IGSF21Q96ID5 467 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TTPALQ9BTX7 342 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RNF14Q9UBS8 474 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FGBP02675 491 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CPB1P15086 417 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SDC4P31431 198 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 NIPA2Q8N8Q9 360 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CNPY3Q9BT09 278 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 USP18Q9UMW8 372 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 LRRD1A4D1F6 860 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SYN3O14994 580 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA0754O94854 1291 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 KRT1P04264 644 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 DNAJB2P25686 324 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MAN1A1P33908 653 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TRADDQ15628 312 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FAM81AQ8TBF8 368 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 AMACRQ9UHK6 382 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RASSF9O75901 435 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FYNP06241 537 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RARAP10276 462 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SNCBQ16143 134 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ATG4AQ8WYN0 398 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TBCBQ99426 244 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.98■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 PSTPIP1O43586 416 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 KCNJ1P48048 391 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SNX16P57768 344 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FPGSQ05932 587 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 DBN1Q16643 649 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZBED2Q9BTP6 218 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ESYT3A0FGR9 886 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SART1O43290 800 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 HDAC4P56524 1084 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF280DQ6N043 979 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA1841Q6NSI8 718 aa16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RAD51CO43502 376 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ERLIN1O75477 346 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 VNN2O95498 520 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZBED1O96006 694 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 DAOAP59103 153 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 VSNL1P62760 191 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ODF2Q5BJF6 829 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 RAB41Q5JT25 222 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.96■□□□□ 0.31
CHTF18-202ENST00000317063 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms