RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TOM1L1O75674 476 aa23.49■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAPNS1P04632 268 aa23.49■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRKCHP24723 683 aa23.49■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NFIAQ12857 509 aa23.49■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NDUFAF2Q8N183 169 aa23.49■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIMS3Q9UJD0 308 aa23.49■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLX4Q8IY92 1834 aa23.49■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBP3P10745 1247 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF23P17027 643 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRDX6P30041 224 aa23.48■■□□□ 1.35
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNJ11Q14654 390 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZACNQ401N2 412 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNAJC28Q9NX36 388 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLLQ9UGP5 575 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NPTX2P47972 431 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALDH3B2P48448 385 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAZQ16635 292 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HAUS8Q9BT25 410 aa23.48■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BMPR2Q13873 1038 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDPK2PQ6A1A2 396 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FRMD7Q6ZUT3 714 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EFCAB3Q8N7B9 438 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JDP2Q8WYK2 163 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IDH3AP50213 366 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLDN10P78369 228 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZFP1Q6P2D0 407 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AMIGO2Q86SJ2 522 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VPS50Q96JG6 964 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PFDN4Q9NQP4 134 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STK39Q9UEW8 545 aa23.47■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHADO15335 359 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 E2F6O75461 281 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALDH2P05091 517 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT7P08729 469 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 THRAP10827 490 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GARTP22102 1010 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC1A6P48664 564 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MBLAC2Q68D91 279 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRPC4APQ8TEL6 797 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OSBPL6Q9BZF3 934 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KMT5AQ9NQR1 393 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.46■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MCF2LO15068 1137 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AVILO75366 819 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FUT4P22083 530 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KDELR1P24390 212 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSMD7P51665 324 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAVSQ7Z434 540 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CERS5Q8N5B7 392 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLC2Q9H0B6 622 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RRN3Q9NYV6 651 aa23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIPA1L1O43166 1804 aa23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KAT6AQ92794 2004 aa23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SERPINB7O75635 380 aa23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PFKPQ01813 784 aa23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MMP19Q99542 508 aa23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RTKNQ9BST9 563 aa23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.45■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LOC100653049A0A140TA62 436 aa23.44■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM150BA6NC51 233 aa23.44■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa23.44■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT34O76011 436 aa23.44■■□□□ 1.34
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GSRP00390 522 aa23.44■■□□□ 1.34
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