RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 RARAP10276 462 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 DEUP1Q05D60 604 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 NME3Q13232 169 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 BOLA3Q53S33 107 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TEKT4Q8WW24 435 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 H3BNC9 293 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 FSCN2O14926 492 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 GLUD1P00367 558 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ITIH3Q06033 890 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TWF1Q12792 350 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PLD1Q13393 1074 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 GPM6BQ13491 265 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF12Q16514 161 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAM32Q8TC27 787 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF139Q8WU17 664 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPH1Q92598 858 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 DDIT4Q9NX09 232 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 COX16Q9P0S2 106 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMA3Q16787 3333 aa21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 MDM4O15151 490 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 F9P00740 461 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31D3P0C874 917 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PGFP49763 221 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 EPHB3P54753 998 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 COPS2P61201 443 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 LILRA6Q6PI73 481 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TAC4Q86UU9 113 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM131BQ86XD5 332 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RAPGEF5Q92565 580 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PIGVQ9NUD9 493 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 BMP8BP34820 402 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMK1Q14012 370 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 KCTD6Q8NC69 237 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 MYRFLQ96LU7 910 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 OSER1Q9NX31 292 aa21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TADA3O75528 432 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 GBP1P32455 592 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 IRS1P35568 1242 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 KRIT1O00522 736 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 RALAP11233 206 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 KDELR1P24390 212 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 C2orf54Q08AI8 447 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 ITIH5Q86UX2 942 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 TDHQ8IZJ6 230 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 OSBPL8Q9BZF1 889 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 IGLV3-25P01717 112 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 LRG1P02750 347 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN7P35236 360 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 CLCN4P51793 760 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 AIF1P55008 147 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP2R5EQ16537 467 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC185Q8N715 623 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMG2Q969U7 264 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 SERPINB11Q96P15 392 aa21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3-201ENST00000298838 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.57■■□□□ 1.04
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