RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278064.6

CFAP43-201, Transcript of cilia and flagella associated protein 43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CFAP43, Length 2,963 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP43-201ENST00000278064 PIRO00625 290 aa14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 PHBP35232 272 aa14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 SLC6A3Q01959 620 aa14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 SNCBQ16143 134 aa14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 CNTN3Q9P232 1028 aa14.67□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 CFAP73A6NFT4 308 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 SMAPO00193 183 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 MCF2LO15068 1137 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 CHUKO15111 745 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 HDAC4P56524 1084 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 BNIP1Q12981 228 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 SPARCL1Q14515 664 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 KCNA10Q16322 511 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 RNF43Q68DV7 783 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 CCDC185Q8N715 623 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 NOD1Q9Y239 953 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 A0A1W2PPM1 405 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 M0QZ92 97 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 TYROBPO43914 113 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 TMEM63AO94886 807 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 BRCC3P46736 316 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 CACNA2D1P54289 1103 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 NCALDP61601 193 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 MGAT5Q09328 741 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 DPYSL3Q14195 570 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 FITM2Q8N6M3 262 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 CD248Q9HCU0 757 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.66□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 UNCXA6NJT0 531 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 GOLGA8RI6L899 631 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 KCNN4O15554 427 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 IL4RP24394 825 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 GBE1Q04446 702 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 TP53INP2Q8IXH6 220 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 DEFB106AQ8N104 65 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 TBCBQ99426 244 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 RNF186Q9NXI6 227 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 AMPD1P23109 780 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 RBL1P28749 1068 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 ECT2Q9H8V3 914 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CFAP43-201ENST00000278064 CREB3O43889 395 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 MGEA5O60502 916 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 BCAR1P56945 870 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 NOMO1Q15155 1222 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 PDK4Q16654 411 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 PKDCCQ504Y2 493 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 TTC39CQ8N584 583 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 EDEM1Q92611 657 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 SENP8Q96LD8 212 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 B3GAT3O94766 335 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 SLC10A3P09131 477 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 TSHRP16473 764 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 CA4P22748 312 aa14.64□□□□□ -0.07
CFAP43-201ENST00000278064 DNAJC3Q13217 504 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms