RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZNB5 142 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 MIB1Q86YT6 1006 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 BBS7Q8IWZ6 715 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 PJA1Q8NG27 643 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.33■■□□□ 1.33
SYF2-201ENST00000236273 MAN2B1O00754 1011 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 ERBB2P04626 1255 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 IRF1P10914 325 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 GJA4P35212 333 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CDR2Q01850 454 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 TAF5Q15542 800 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 RHBDF2Q6PJF5 856 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 FAM3CQ92520 227 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 ATP2A3Q93084 1043 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL6Q9BZF3 934 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.33■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 FAM170BA6NMN3 283 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 STK25O00506 426 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 MSANTD2Q6P1R3 559 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 ZNF677Q86XU0 584 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 TMEM35BQ8NCS4 154 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 MSANTD3Q96H12 275 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB18PQ96TA0 734 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 IFNKQ9P0W0 207 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D14Q9P2M4 693 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.32■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CYP17A1P05093 508 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 DCNP07585 359 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 GABRB2P47870 512 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 NOMO3P69849 1222 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 COG7P83436 770 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 DHCR24Q15392 516 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 BEND5Q7L4P6 421 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 RNF214Q8ND24 703 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CLDN23Q96B33 292 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 P2RY11Q96G91 374 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 NELL2Q99435 816 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 MYO6Q9UM54 1294 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 MIA3Q5JRA6 1907 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SLC12A8A0AV02 714 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 ARID5AQ03989 594 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 UBXN2BQ14CS0 331 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 FIGNQ5HY92 759 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CPA6Q8N4T0 437 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 OTUB2Q96DC9 234 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SYT11Q9BT88 431 aa23.3■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 FAM170AA1A519 330 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 NFATC1O95644 943 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 LSM8O95777 96 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 HMBSP08397 361 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CHRNB1P11230 501 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 UNGP13051 313 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 PON2Q15165 354 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 RNF139Q8WU17 664 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 NOX5Q96PH1 765 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 LRRC53A6NM62 1247 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 MSI1O43347 362 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 NCAM1P13591 858 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 OPRD1P41143 372 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 GALK1P51570 392 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 C2CD6Q53TS8 623 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 NAA35Q5VZE5 725 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 TMEM25Q86YD3 366 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-201ENST00000236273 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms