RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211953.1

Lncbate1-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lncbate1, Length 812 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rxfp1Q6R6I7 758 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sdad1Q80UZ2 687 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pcsk9Q80W65 694 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hspbap1Q8BK58 483 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slco2b1Q8BXB6 683 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 MetrnQ8C1Q4 291 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm6367Q8C6L9 287 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 KyQ8C8H8 661 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Eif2b5Q8CHW4 717 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dennd1aQ8K382 1016 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Oas1gQ8K469 367 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ces2aQ8QZR3 558 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Prrg2Q8R182 198 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Prpsap2Q8R574 369 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fbxw7Q8VBV4 629 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc65Q8VHI7 493 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pip4k2cQ91XU3 421 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pcdha10Q91Y20 946 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mettl13Q91YR5 698 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pde2aQ922S4 916 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Smc6Q924W5 1097 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q9D454 513 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rabl3Q9D4V7 236 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ttc33Q9D6K7 262 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Znrf4Q9DAH2 327 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fundc1Q9DB70 155 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Doc2gQ9ESN1 387 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Timp4Q9JHB3 224 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Piwil1Q9JMB7 862 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tk2Q9R088 270 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wdr54Q9R0D8 334 aa7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atg2aQ6P4T0 1914 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Plxna3P70208 1872 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lonrf1D3YY23 762 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm10717D3Z1I8 228 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Adgrf2E9Q4J9 644 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cyp2b23E9Q593 491 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Serpine3E9Q6A2 401 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm3460E9QAI8 215 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm10722F6VLK5 217 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Serpinb9O08797 374 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Odc1P00860 461 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Eno1P17182 434 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cd247P24161 164 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 FynP39688 537 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 GsrP47791 500 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Evx2P49749 475 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Opa1P58281 960 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Uchl4P58321 233 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nrp1P97333 923 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 MylpfP97457 169 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Igsf9Q05BQ1 1179 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gpr15Q0VDU3 360 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fut7Q11131 389 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 HelqQ2VPA6 1069 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pid1Q3UBG2 217 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mrgprx2Q3UG50 352 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TceancQ3US16 359 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lipo3Q3UT41 399 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Q3UTZ3 580 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tspyl3Q3UYP3 334 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Xkr5Q5GH66 676 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Bcar1Q61140 874 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mef2dQ63943 514 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kiaa1841Q68FF0 718 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atl2Q6PA06 583 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Spag7Q7TNE3 227 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Stk40Q7TNL3 435 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zswim6Q80TB7 1207 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Chn2Q80XD1 332 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Clec2eQ80XD9 204 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gpt2Q8BGT5 522 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 FtoQ8BGW1 502 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rassf2Q8BMS9 326 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fam43aQ8BUP8 424 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gpr20Q8BYC4 358 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Samd3Q8C4H2 520 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pde10aQ8CA95 790 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slfn5Q8CBA2 884 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Abi1Q8CBW3 481 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Inpp5fQ8CDA1 1132 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Spdye4bQ8CDE8 236 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mta1Q8K4B0 715 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 OafQ8QZR4 282 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fam151aQ8QZW3 608 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Igsf8Q8R366 611 aa7.37□□□□□ -1.23
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 SarafQ8R3Q0 334 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.6 ms