RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc103Q9D9P2 237 aa12.46□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nfu1Q9QZ23 255 aa12.46□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Myh7Q91Z83 1935 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 ShdO88834 343 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fgfr1P16092 822 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cxcl9P18340 126 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SpdyaQ5IBH7 310 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PostnQ62009 838 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 ChpfQ6IQX7 774 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tas2r102Q7M717 329 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Armc12Q80X86 340 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gabra5Q8BHJ7 463 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Elmo2Q8BHL5 732 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mob2Q8VI63 235 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kdm4bQ91VY5 1086 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Hdhd5Q91WM2 419 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pacsin3Q99JB8 424 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Myh8P13542 1937 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mcf2A2AEU1 1111 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rhox3cA2AWM0 215 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rhox3hL7MU37 215 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pbx3O35317 434 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rhox3aQ4TU90 215 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tarsl2Q8BLY2 790 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vangl2Q91ZD4 521 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cul3Q9JLV5 768 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Wfdc16A2A5H4 111 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sh2d4bA6X942 431 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ces1bD3Z5G7 567 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kctd18E0CZ26 429 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Krt90E9Q1Z0 538 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm43302L7N1X8 611 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 TyrobpO54885 114 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gbp10Q000W5 611 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q3TQQ9 903 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q3UE31 404 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 GmncQ3URY2 333 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Xlr3bQ6P205 226 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mbtd1Q6P5G3 631 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Afap1l1Q8BZI0 768 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q8R1Y2 203 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CrygnQ8VHL5 183 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Snx2Q9CWK8 519 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 CitP49025 2055 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 RptorQ8K4Q0 1335 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mmp15O54732 657 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Akr1b7P21300 316 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 GlrbP48168 496 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PctpP53808 214 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sema3cQ62181 751 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmc8Q7TN58 722 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kcns3Q8BQZ8 491 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Clec1aQ8BWY2 269 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lmo3Q8BZL8 145 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pde10aQ8CA95 790 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Agbl2Q8CDK2 862 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Vmn1r203Q8R273 311 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ankrd49Q8VE42 238 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rabep2Q91WG2 554 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gstt4Q9D4P7 240 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rtl9Q32KG4 1339 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Aldoart1A6ZI46 419 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PrkchP23298 683 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tlx1P43345 332 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ephb2P54763 986 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Hmgb4Q6P8W9 181 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Znf821Q6PD05 413 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trpm4Q7TN37 1213 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mapk15Q80Y86 549 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zbtb41Q811F1 908 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cdk9Q99J95 372 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam227bQ9D518 532 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Adrm1Q9JKV1 407 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lactbl1S4R213 581 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dhtkd1A2ATU0 921 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nr3c1P06537 783 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pdcd1Q02242 288 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ccdc138Q0VF22 680 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trmt1Q3TX08 663 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Slc20a1Q61609 681 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ripor1Q68FE6 1223 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam107aQ78TU8 144 aa12.44□□□□□ -0.42
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Glra2Q7TNC8 452 aa12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.9 ms