RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 USP33Q8TEY7 942 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP2A3Q93084 1043 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 INVSQ9Y283 1065 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM208BQ5VWN6 2430 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 C4orf47A7E2U8 309 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 HUS1O60921 280 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 LDHAP00338 332 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNAR2P48551 515 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK17Q00537 523 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ELF2Q15723 593 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PMS2CLQ68D20 193 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA18Q8TC71 538 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ACDQ96AP0 544 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP2C2O75185 946 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOBTB1O94844 696 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CKMP06732 381 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 BCKDHBP21953 392 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA11P43364 429 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CPLX3Q8WVH0 158 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRJQ12913 1337 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PROS1P07225 676 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 VAMP7P51809 220 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 USP46P62068 366 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 MYL7Q01449 175 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 MESP2Q0VG99 397 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 GBP6Q6ZN66 633 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRF2Q8IZF7 708 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 NEK11Q8NG66 645 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TPSD1Q9BZJ3 242 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 THADAQ6YHU6 1953 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PATE3B3GLJ2 98 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QTNF9P0C862 333 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 LMO2P25791 158 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2H1P32780 548 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCN1P35523 988 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 DGKEP52429 567 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 MEA1Q16626 185 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 GPD1LQ8N335 351 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC16Q8NEE8 873 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 MTMR12Q9C0I1 747 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CRTAC1Q9NQ79 661 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CCP110O43303 1012 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 LHX1P48742 406 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 FMO5P49326 533 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN4BQ8IWT1 228 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 MDGA1Q8NFP4 955 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 TSTD1Q8NFU3 115 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO6Q9UM54 1294 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 NME7Q9Y5B8 376 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF233A6NK53 670 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 HDCP19113 662 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 CETN1Q12798 172 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 MYLPFQ96A32 169 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC4Q96A65 974 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA17Q96L03 361 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 PCSK1P29120 753 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN10P78369 228 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 RBP5P82980 135 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf27AQ580R0 203 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM92Q6UXU6 159 aa25.49■■□□□ 1.67
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