RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 LMAN2Q12907 356 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM61Q5EBN2 209 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT18Q6ZVK8 323 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 SV2AQ7L0J3 742 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 ARMCX6Q7L4S7 300 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf29Q8N999 325 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TMC2Q8TDI7 906 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 STARD13Q9Y3M8 1113 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 PDXKO00764 312 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM24O15164 1050 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 TBX18O95935 607 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 ASS1P00966 412 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 NR3C1P04150 777 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 ASPAP45381 313 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 C10orf76Q5T2E6 689 aa26.34■■□□□ 1.81
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PTPRF-216ENST00000617451 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.34■■□□□ 1.81
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PTPRF-216ENST00000617451 WASF3Q9UPY6 502 aa26.34■■□□□ 1.81
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PTPRF-216ENST00000617451 DPP6P42658 865 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 UAP1L1Q3KQV9 507 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf220Q5T0J3 134 aa26.33■■□□□ 1.81
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PTPRF-216ENST00000617451 SPOPLQ6IQ16 392 aa26.33■■□□□ 1.81
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PTPRF-216ENST00000617451 SCML2Q9UQR0 700 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 PI4KAP42356 2102 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRF-216ENST00000617451 PROS1P07225 676 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 FAM200BP0CF97 657 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 GABRG2P18507 467 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 NTSR1P30989 418 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC23A3Q6PIS1 610 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa26.32■■□□□ 1.8
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PTPRF-216ENST00000617451 OSER1Q9NX31 292 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 ZZEF1O43149 2961 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQF6 199 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 HHLA1C9JL84 531 aa26.31■■□□□ 1.8
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PTPRF-216ENST00000617451 ITPKAP23677 461 aa26.31■■□□□ 1.8
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PTPRF-216ENST00000617451 MYH10P35580 1976 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 AP5Z1O43299 807 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 TYRP14679 529 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 ENGP17813 658 aa26.3■■□□□ 1.8
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PTPRF-216ENST00000617451 PIK3CAP42336 1068 aa26.3■■□□□ 1.8
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PTPRF-216ENST00000617451 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 CEP135Q66GS9 1140 aa26.3■■□□□ 1.8
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PTPRF-216ENST00000617451 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa26.3■■□□□ 1.8
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PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 KLHDC10Q6PID8 442 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 SLC36A4Q6YBV0 504 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB124Q8NES8 71 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 ACOX2Q99424 681 aa26.29■■□□□ 1.8
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PTPRF-216ENST00000617451 MYL1P05976 194 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 ACO1P21399 889 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
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