RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 DEC1Q9P2X7 70 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 CFAP54Q96N23 3096 aa20.19■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 SDHBP21912 280 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TIE1P35590 1138 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 GRIA2P42262 883 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 PGFP49763 221 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 BCAT1P54687 386 aa20.18■□□□□ 0.82
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ANKRD54-211ENST00000609454 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.18■□□□□ 0.82
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ANKRD54-211ENST00000609454 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 NMUR1Q9HB89 426 aa20.18■□□□□ 0.82
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ANKRD54-211ENST00000609454 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
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ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.18■□□□□ 0.82
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ANKRD54-211ENST00000609454 ALDH1A2O94788 518 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 VDRP11473 427 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 HOXC13P31276 330 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 LMNB2Q03252 620 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 CAMK4Q16566 473 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TTI2Q6NXR4 508 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM270Q6UE05 265 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 HTR3DQ70Z44 454 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 PIGZQ86VD9 579 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 USP33Q8TEY7 942 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 OSER1Q9NX31 292 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 MYH10P35580 1976 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 MDM4O15151 490 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 P4HA2O15460 535 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 HMBSP08397 361 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TNFRSF4P43489 277 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TKTL1P51854 596 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 COG7P83436 770 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGAP8P85298 464 aa20.16■□□□□ 0.82
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ANKRD54-211ENST00000609454 EFEMP1Q12805 493 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM25Q86YD3 366 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 BBS2Q9BXC9 721 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 USP3Q9Y6I4 520 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 LRP3O75074 770 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 ZBED1O96006 694 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 BMP6P22004 513 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 GBP1P32455 592 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-211ENST00000609454 KCNH2Q12809 1159 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 ELF2Q15723 593 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 GAB4Q2WGN9 574 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 C12orf40Q86WS4 652 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 UBA3Q8TBC4 463 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 WBP2Q969T9 261 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 RMDN1Q96DB5 314 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 DCLK3Q9C098 648 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-211ENST00000609454 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-211ENST00000609454 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-211ENST00000609454 FOXK2Q01167 660 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-211ENST00000609454 PDE4CQ08493 712 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-211ENST00000609454 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-211ENST00000609454 EOGTQ5NDL2 527 aa20.14■□□□□ 0.81
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