RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	IKBKB	O14920	756 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TULP3	O75386	442 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	KIF20A	O95235	890 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	MYL1	P05976	194 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	KRT13	P13646	458 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	GRIA2	P42262	883 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TUB	P50607	506 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	PNOC	Q13519	176 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	PMS2CL	Q68D20	193 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	EDEM2	Q9BV94	578 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A1W2PQ27	194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A1W2PQ64	194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A1W2PQD8	194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	LNP1	A1A4G5	178 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	MAPK13	O15264	365 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	CILP	O75339	1184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF202	O95125	648 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	CAVIN2	O95810	425 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	LIMK1	P53667	647 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	GAD2	Q05329	585 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	ACOX2	Q99424	681 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	VPS45	Q9NRW7	570 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	PI4KA	P42356	2102 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	IGF2R	P11717	2491 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TM4SF5	O14894	197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	RHOBTB1	O94844	696 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	ADAM9	Q13443	819 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	NFIL3	Q16649	462 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TERB1	Q8NA31	727 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TATDN2	Q93075	761 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	COMMD8	Q9NX08	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	PLK2	Q9NYY3	685 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	DEC1	Q9P2X7	70 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	NAGPA	Q9UK23	515 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		13.58	□□□□□ -0.23
FCHO1-233	ENST00000600393	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	GIPC1	O14908	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	HMBS	P08397	361 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	RARG	P13631	454 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	TYR	P14679	529 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	P2RY2	P41231	377 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	PTGER3	P43115	390 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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